ポップアップ内に最初のボタンがある場合、シナリオはボタンを押したタイミングでスタートしますか？

ボタンを押したタイミングではなく、そのボタンが表示されているシナリオ画面に到達した時点でSTEP1のセッション数に含まれます。そのため、ポップアップを開いたが最初のボタンを押さなかった場合、開いた後に何もせず閉じた場合、開いた後に別の導線に進んだ場合も、STEP1のセッションとしてカウントされます。STEP1のセッション数は「シナリオの入口が表示された数」として捉えていただくのが適切です。